Поскольку подготовка образцов для секвенирования следующего поколения (NGS) включает в себя множество этапов, и каждый из них имеет решающее значение для общего успеха и эффективности секвенирования, все этапы должны быть оптимизированы с точки зрения реагентов и протокола. Учитывая ценный характер образцов NGS, необходим интегрированный рабочий процесс с оптимизированными реагентами для преобразования образцов в библиотеку, готовую к секвенированию. Типы образцов NGS могут различаться по своим характеристикам:
Простота секвенирования - однородные или со вторичными структурами или богатыми GC участками
Качество - свежевыделенные или законсервированные (формалин-фиксированные парафиновые вкрапления - FFPE)
Гибкость рабочих процессов - рабочие процессы для ДНК и РНК оптимизированы для конкретных задач
Учитывая все эти различия, важно использовать реагенты для подготовки библиотек, которые могут эффективно работать со всеми этими типами образцов. Высококачественные реагенты для подготовки библиотек помогают добиться равномерного и улучшенного покрытия, а также снизить количество дублирований. В зависимости от конечной цели (например, секвенирование целого экзома) может потребоваться этап обогащения мишеней для обогащения определенных регионов, представляющих интерес. Использование высокоэффективных реагентов для обогащения мишеней помогает получить равномерное и высокое покрытие с высокой специфичностью (on-target rate) для целевых регионов.
KAPA HyperPETE Workflow объединяет проверенные продукты для подготовки библиотек KAPA и обогащения мишеней KAPA. Он предоставляет все принадлежности и реагенты, необходимые для подготовки образцов, от ДНК или РНК до секвенатора в рамках однодневного рабочего процесса. Новые панели KAPA HyperPETE обеспечивают высокую эффективность захвата, однородность секвенирования при меньшей оптимизации и более высокую достоверность обнаружения вариантов.
---