Повысьте точность и пропускную способность с помощью адаптеров и аксессуаров KAPA
При секвенировании нового поколения (NGS) использование индексированных адаптеров для маркировки образцов значительно повышает эффективность. Этот процесс, известный как мультиплексирование, позволяет объединять множество образцов в один цикл секвенирования, а полученные чтения затем сортируются с помощью биоинформатики.
Однако некоторые высокопроизводительные секвенаторы подвержены ошибочному присвоению индексов (index hopping), что может снизить качество данных. Стратегии уникальной двойной индексации (UDI) помогают смягчить последствия таких событий.
Компания Roche предлагает два типа адаптеров KAPA:
Адаптеры полной длины: для подготовки образцов без ПЦР с поддержкой до 96 комбинаций индексов
Адаптеры KAPA UDI
Краткий обзор преимуществ
Низкая частота ошибочного присвоения индексов повышает достоверность результатов
Неправильное присвоение индексов при мультиплексном секвенировании может быть вызвано несколькими факторами, в том числе:
«Прыжки» индексов
Перекрёстное загрязнение штрих-кодов или образцов
Смена матрицы во время ПЦР-амплификации объединенных образцов
Ошибки секвенирования или анализа
Некоторые из этих проблем можно смягчить за счет тщательной разработки адаптеров и контроля качества.
Адаптеры KAPA UDI разработаны для обеспечения достоверности результатов за счёт:
Уникальных комбинаций двойных индексов, позволяющих отфильтровывать чтения с неожиданными комбинациями штрих-кодов до начала анализа данных
---