Набор реактивов в растворе KAPA HyperPETE

для исследованийдля ДНК

KAPA HyperPETE Workflow — это инновационная технология гибридного захвата, основанная на использовании реакций удлинения праймеров для специфического захвата и высвобождения молекул целевой библиотеки с целью секвенирования. Каталог панелей KAPA HyperPETE включает готовые панели фиксированной конфигурации для вариантов генов, связанных со всеми видами рака (с модулем MSI), онкологических «горячих точек», наследственных онкологических заболеваний, вариантов слияния генов при раке легких и скрининга новорожденных. Эти панели фиксированной конфигурации созданы на основе более чем десятилетнего опыта разработки зондов. Краткий обзор преимуществ Разработано для выявления важной геномной информации из сложных типов образцов РНК из тканей (FFPET) Обеспечивает высокоспецифическое обогащение при широком диапазоне исходных количеств РНК из FFPET (рис. 1) Обнаруживает все слияния, присутствующие в образцах эталонных клеточных линий (табл. 1) cfDNA в плазме Обеспечивает высокий процент чтений в целевой области и высокое покрытие экзонов (≥1000X) для широкого диапазона исходных количеств cfDNA в плазме (рис. 2) Обнаруживает варианты с высокой чувствительностью при различных исходных количествах cfDNA в плазме Характеристики при использовании РНК из FFPE с панелью KAPA HyperPETE LC Fusion Panel. Панель KAPA HyperPETE Lung Cancer Fusion Panel обеспечила 92–97 % чтений в целевой области при исходных количествах 10 нг и 50 нг для всех протестированных образцов FFPE. Высокая специфичность была подтверждена высоким процентом чтений по целевым участкам при использовании в качестве исходного материала от 10 нг до 50 нг РНК из FFPE различного качества (низкого, среднего, высокого). Доля считываний в целевой области составила от 92 % до 97 % (включая гени-хаускипинг и мишени слияния) с хорошей производительностью при всех количествах, качествах и типах исходных образцов. Доля считываний в целевой области рассчитывалась после удаления считываний рРНК (от 0,8 % до 11 % от всех считываний). Для оценки эффективности были использованы два (2) образца клеточных линий (в двух повторах) и четырнадцать (14) образцов нормальной прилегающей ткани FFPET.