Набор для подготовки библиотек РНК Seq был разработан для создания высококачественных библиотек NGS для секвенирования следующего поколения (платформы illumina и MGI). Секвенирование РНК является очень мощным инструментом для анализа транскриптома, такого как экспрессия генов и регуляция транскрипции, характеристика сплайсинга, обнаружение мутаций и вариаций и т.д. В качестве исходного материала для создания библиотеки в наборе используется очищенная РНК (например, обедненная рРНК или полиА мРНК). Возможно мультиплексирование библиотек с помощью различных типов индексов.
Для наборов платформы illumina доступны три типа индексов:
Без индекса: Библиотеки не имеют индекса.
Индекс: в каждый из индексных праймеров включена уникальная последовательность штрих-кода из 6 оснований. Мультиплексирование библиотек РНК-секвенирования возможно с 48 образцами. Информацию об индексе можно загрузить здесь.
Уникальный двойной индекс: мультиплексирование библиотеки РНК-секвенирования до 96 образцов возможно с уникальными двойными индексами. Мы разработали систему индексов с разницей в 4 основания. Система может генерировать индексы, по крайней мере, с 4 основаниями, отличающимися от других в 8-базовой области индексирования. Уникальные праймеры для двойного индексирования выявляют ошибки секвенирования, такие как скачки индексов, неправильное распределение и ошибки де-мультиплексирования. Информацию об индексах можно загрузить здесь.
Индексы доступны для наборов платформы MGI.
Характеристики
Быстрый протокол
Библиотеки будут готовы через 2 часа
Время практической работы составляет всего ~10 минут
Гарантированное качество
Высокая производительность
Равномерное покрытие транскриптов
Простой рабочий процесс
Количество исходной очищенной РНК: От 3 нг до 100 нг
---