Набор для подготовки библиотек NGS DNA без ПЦР был разработан для создания библиотек ДНК для секвенирования следующего поколения (платформа illumina). Набор эффективно добавляет 3′-dT-хвостовые библиотечные адаптеры к обоим концам фрагментов ДНК. Набор использует двухцепочечные фрагменты ДНК (тупые и/или липкие) в качестве исходной ДНК для создания библиотек NGS и совместим с фрагментами ДНК, полученными как энзиматическими (ферменты фрагментации ДНК BioDynami и др.), так и физическими методами (соникация, распыление и др.)
ПЦР-амплификация является стандартным этапом подготовки библиотек для секвенирования следующего поколения. ПЦР используется для амплификации полностью лигированных фрагментов ДНК и добавления индексной информации в библиотеки. Индексация служит для объединения образцов библиотеки в пул с целью снижения стоимости секвенирования.
Однако ПЦР приводит к неравномерной амплификации ДНК в некоторых регионах ДНК с экстремальными GC-содержаниями и вторичными структурами. Это смещение может привести к очень низкому покрытию секвенирования в таких регионах. Секвенирование ДНК в таких регионах по-прежнему представляет собой огромную проблему.
Подготовка библиотеки без ПЦР позволяет уменьшить смещение библиотеки и минимизировать пробелы в секвенировании. Данные секвенирования, полученные из образцов библиотеки без ПЦР, имеют равномерное геномное покрытие с небольшим количеством пробелов и лучшую глубину в регионах, богатых GC. Наш набор для NGS без ПЦР обеспечивает оптимальное покрытие в традиционно сложных регионах, таких как регионы с высоким содержанием GC, регионы с низким содержанием GC и регионы с повторяющимися последовательностями.
Для набора доступны два типа индексов:
Неиндексный: Библиотеки не имеют индекса.
Индекс: Каждая библиотека содержит один индекс i5 и один индекс i7. Возможно мультиплексирование библиотек до 96 образцов. Список индексов можно скачать здесь.
---