Набор реактивов подготовки банков ДНК 3010 series

ферментбуферный раствордля преобразования в бисульфите

Бисульфитное секвенирование - хорошо известная технология для выявления метилирования ДНК, а для анализа метилирования ДНК всего генома используется несколько технологий, таких как WGBS, RRBS, MeDIP-Seq и MSBS. Метилирование ДНК играет важную роль в регуляции развития клеток, дифференциации и экспрессии генов в молекулярной биологии, генетике и эпигенетике. Большинство метилированных цитозинов находятся в сайтах CpG, и 70-80% цитозинов метилированы. Количество CpG-сайтов в геноме человека составляет около 28 миллионов, что составляет менее 1% генома по сравнению с ожидаемыми 4,4%. Цельногеномное бисульфитное секвенирование (WGBS) является наиболее эффективным методом анализа метилирования ДНК. Единственное ограничение - стоимость секвенирования очень высока, поскольку секвенируется весь геном, включая все неметилированные участки. Бисульфитное секвенирование с уменьшенным представительством (RRBS) - это уменьшенное представительство меньшей части метилированных CpG-сайтов. RRBS сочетает в себе переваривание ферментами рестрикции и бисульфитное секвенирование, обогащая секвенирование метилированными CpG-сайтами. Это эффективная технология для оценки паттернов метилирования всего генома на уровне одного основания. Хотя это позволяет увеличить глубину покрытия и снизить стоимость секвенирования, ограничение заключается в том, что покрывается только 10 % метилированных CpG-сайтов. Иммунопреципитационное секвенирование метилированной ДНК (MeDIP-Seq) - еще один метод обогащения всего генома, используемый для отбора метилированной ДНК. Используя антитела против 5-метилцитозина, метилированную ДНК выделяют из цельной геномной ДНК путем иммунопреципитации. антитела к 5-метилцитозину инкубируются с фрагментированной геномной ДНК и осаждаются, после чего проводится очистка ДНК и секвенирование.