Набор был разработан для создания высококачественных библиотек для секвенирования следующего поколения (платформы illumina и MGI). Набор использует двухцепочечные фрагменты ДНК (тупые и/или липкие) в качестве исходной ДНК для подготовки библиотеки NGS и совместим с фрагментами ДНК, полученными как ферментативными, так и физическими методами (соникация, распыление и т.д.). Возможно мультиплексирование библиотек с использованием различных типов индексов.
Набор оптимизирован для подготовки библиотек для секвенирования следующего поколения (NGS) с различными типами образцов. В большинстве случаев подготовка библиотеки ДНК требует лигирования фрагментов ДНК с адаптерами библиотеки, а подготовка библиотеки ДНК тесно связана с качеством данных NGS. Благодаря уникальным технологиям подготовки библиотек ДНК, разработанным компанией BioDynami, этот быстрый и простой набор позволяет подготовить высококачественную библиотеку NGS за 1,5 часа, затратив всего 10 минут рабочего времени.
Некоторые геномные регионы очень трудно покрыть равномерно, что обычно приводит к очень низкой степени покрытия или пробелам в этих регионах.
Типичными сложными регионами являются:
- с высоким содержанием GC
- имеют вторичные структуры: в основном за счет повторяющихся последовательностей
- худшие случаи: имеют как высокое содержание GC, так и повторяющиеся последовательности.
Пример: ген TERT человека - один из самых сложных регионов, как показано выше. Данные NGS показали, что набор BioDynami обладает наилучшими характеристиками для покрытия чрезвычайно сложной области гена TERT человека.
Для наборов для платформы illumina доступны три типа индексов:
Без индекса: библиотеки не имеют индекса.
Индекс: В каждый из индексных праймеров включена уникальная последовательность штрих-кода из 6 оснований.
---