Панели Swift Amplicon HS обеспечивают обнаружение сверхнизкочастотного варианта при МАФ менее 1% от 10-20 нг безклеточной ДНК (cfDNA) для секвенсоров Illumina®. Нуклеотидные ошибки, обычно возникающие во время ПЦР и секвенирования, удаляются с помощью реализации уникальных молекулярных идентификаторов (MID или UMI), которые уникальным образом маркируют шаблоны мишеней во время амплификации.
Основные моменты
- Чувствительные и специфические надежно обнаруживают SNV и инделы до 0,25% частоты аллелей
- Совместимость с кфДНК и ФПФЭ, усиливается от 10-50 нг кфДНК
- Быстрый рабочий процесс, высокое качество данных От ДНК до библиотек, совместимых с Illumina®, в течение 3 часов
- Инструменты анализа парных данных - на базе облака или с открытым исходным кодом
Панели Swift Amplicon HS позволяют использовать вариант вызова на частоте 1% и ниже, с аллельной чувствительностью, зависящей от количества входного материала и глубины секвенирования. Используя 10 нг входной ДНК, этот анализ последовательно обнаруживает варианты на 0,5% с рекомендуемой глубиной секвенирования не менее 60 000x (1M чтений) до дедупликации с МИД и 0,25% от 20 нг входной ДНК.
Панели Swift Amplicon HS облегчают вызов целевого варианта клинически релевантных мутаций на уровне 1% и ниже
Частота. Технология позволяет это сделать за счет включения молекулярных идентификаторов (MID или UMI), которые
повышение чувствительности и специфичности за счет устранения ложноположительных ошибок, вводимых во время ПЦР и секвенирования.
Поддерживаемые приложения
- Онкология - жидкая биопсия кфДНК и FFPE ткани
- Обнаружение генома/хозяина - Графт против болезни хозяина и плода в кфДНК матери*
- Пользовательские цели*
Спецификации
Входная ДНК Требуемая и предел обнаружения 10 нг для обнаружения 0.5%; 20 нг для обнаружения 0.25%
---