Модуль программного обеспечения для HLA-секвенирования SEQHLA

для лабораторийдля анализа

SEQHLA - это мощное и удобное приложение для анализа данных типирования на основе последовательности HLA со всех платформ секвенирования Сэнгера. Все версии базы данных IMGT HLA доступны для загрузки и импорта. Программа использует уникальную обучающуюся программу для вызова базы на основе статистических данных о площади пика и имеет собственную функцию автоматического редактирования. При желании постоянные позиции могут быть проигнорированы для анализа. Результат может быть отображен в максимальном, 1 полевом или 2 полевом разрешении и в виде кода NMPD. Все данные результатов могут быть переданы во внутренние системы LIM лаборатории и/или выданы в виде персонализированных отчетов для пациентов. Совместимость с данными всех распространенных платформ и наборов для секвенирования Sanger Простая настройка отдельных целевых регионов на основе базы данных IMGT HLA Настраиваемая система вызова оснований с пороговыми значениями, зависящими от секвенатора Автоматическая и определяемая пользователем обрезка файлов результатов секвенирования Все результаты для одного пациента отображаются на одном экране, включая обнаруженные комбинации аллелей Автоматическое предупреждение о мутациях сайтов сплайсинга Возможность игнорирования постоянных позиций для анализа Обнаружение новых аллелей Отображение результатов в различных разрешениях (1 поле, 2 поля и макс. разрешение) и в виде кода NMDP Статистика площади пика: автоматическое сравнение со всеми ранее проанализированными образцами для чувствительного обнаружения гетерозиготных позиций даже в случае отсева аллелей Подробный отчет по HLA для отдельных пациентов / заказов