Модуль программного обеспечения для HLA-секвенирования SEQNEXT-HLA

для анализадля картографиидля лабораторий

SEQNEXT-HLA - это мощное и удобное приложение для анализа данных типирования на основе последовательности HLA, полученных с помощью всех распространенных платформ и наборов для секвенирования следующего поколения. Все версии базы данных IMGT HLA доступны для загрузки и импорта. Для расчета результатов можно учитывать последовательности интронов, чтобы исключить нулевые аллели, кроме того, можно проверить фазировку. Предупреждения о покрытии и фоне могут быть показаны. Также вызываются новые аллели. Результат может быть отображен в максимальном, 1 полевом или 2 полевом разрешении и в виде кода NMPD. Все данные результатов могут быть переданы во внутренние LIM-системы лаборатории и/или выданы в виде персонализированных отчетов для пациентов. Совместимость с данными всех распространенных платформ и наборов для секвенирования следующего поколения Простая настройка отдельных целевых регионов (ROIs) на основе базы данных IMGT HLA Анализ fastq- или fastq.gz-файлов Эффективные стандарты для картирования, выравнивания, качества и определения аллелей Конфигурируемые настройки для поиска аллелей Анализ полных локусов (данные по экзонам и интронам) Обнаружение / исключение нулевых аллелей на основе последовательностей интронов Фазовая проверка для устранения неоднозначностей Обнаружение новых аллелей