AmpliSeq for Illumina Focus Panel - это целевой набор для анализа биомаркеров 52 генов, имеющих отношение к солидным опухолям. Используя Focus Panel, исследователи могут одновременно анализировать ДНК и РНК. Ключевые особенности включают:
Содержание релевантных генов
Целевые биомаркеры по 52 генам, относящимся к солидным опухолям
Быстрый, упорядоченный рабочий процесс
Подготовка библиотек, готовых к секвенированию, за один день из всего 1 нг высококачественных или 10 нг формалин-фиксированных, парафинированных (FFPE) исходных образцов
Точные данные
Выявление соматических мутаций с частотой до 5% с помощью локального или облачного анализа
Панель Focus Panel является частью интегрированного рабочего процесса, включающего подготовку библиотеки на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР) AmpliSeq for Illumina, технологию секвенирования методом синтеза (SBS) следующего поколения (NGS) Illumina и автоматизированный анализ.
Эта готовая к использованию панель позволяет сэкономить время и усилия, связанные с определением целей, конструированием праймеров и оптимизацией панелей.
Технические характеристики
Время анализа - 5-6 часов (только подготовка библиотеки; не включает количественное определение, нормализацию и время объединения библиотек)
Тип рака - солидная опухоль
Описание - Исследование соматического анализа 52 генов, ассоциированных с раком солидных опухолей.
Время практической работы - < 1,5 часа
Количество исходного материала - 1-100 нг (рекомендуется 10 нг на пул)
Количество ампликонов - всего 553. 2 пула. (Пул ДНК: 269 ампликонов. Пул РНК: 284 ампликона)
Специализированные типы образцов - ткани FFPE
Класс вариантов - однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs), слияния генов, соматические варианты, вставки-удаления (indels), варианты числа копий (CNVs)
---