Используя технологию GEXSCOPE® компании Singleron, отдельные клетки разделяются на отдельные микроячейки, и мРНК захватываются уникальными бусинами со штрих-кодом. Затем мРНК подвергается обратной транскрипции в кДНК, после чего следует этап циркуляризации, осуществляемый с помощью круговой ручки. Благодаря циркуляции кДНК область V(D)J была приближена к праймеру для секвенирования. После двух раундов обогащения продукты фрагментируются и создаются полноразмерные библиотеки VDJ для секвенирования с коротким прочтением illumina.
Высокая эффективность захвата РНК и специфичность V(D)J
Рекомбинация VDJ - это процесс, в ходе которого Т-клетки и В-клетки случайным образом собирают различные генные сегменты - известные как вариабельные (V), разнообразные (D) и соединительные (J) гены - для создания уникальных рецепторов (известных как антигенные рецепторы), которые могут коллективно распознавать множество различных типов молекул. Область V(D)J является одной из самых разнообразных областей человеческого генома, что способствует сложным иммунным реакциям человека. Поэтому понимание полной длины последовательностей областей V(D)J Т- и В-клеток обеспечивает более точное понимание иммунных процессов.
Основные моменты:
- Всеобъемлющий - сочетание профилирования транскриптома с полноразмерными последовательностями TCR или BCR
- Высокая пропускная способность - одновременная обработка до 10 000 клеток за один прогон
- Высокая скорость картирования - увеличение доли клеток с полноразмерными последовательностями V(D)J
- Высокая эффективность захвата - воспользуйтесь преимуществами надежного захвата полиА
Области применения
01
Иммунное микроокружение
Т- и В-клетки, инфильтрирующие опухоль
02
Аутоиммунные заболевания
Выявление аномальных Т- и В-клеток в иммунной системе
03
Трансплантация
Определите риски отторжения при трансплантации
---