Набор реактивов в растворе CLindex™

подготовки банков ДНКдля подготовки банков РНК

Набор для мультиплексирования образцов CLindex™Sample позволяет объединить до 16 образцов в одной библиотеке для секвенирования одноклеточных. В технологии мультиплексирования CLindex™ используется клик-химия для эффективного и беспристрастного маркирования образцов. Химическая группа с высоким сродством к белкам клеточной поверхности и олиго, связывающееся с этой химической группой, маркируют клетки каждого образца. Основным преимуществом маркировки на основе химии щелчков по сравнению с маркировкой на основе антител является то, что белки клеточной поверхности, распознаваемые химией щелчков, многочисленны и встречаются у разных видов. Кроме того, весь процесс маркировки образца занимает всего 30 минут. Оптимизированный рабочий процесс Метки для образцов добавляются с помощью щелевой химии до объединения образцов в единый рабочий процесс GEXSCOPE®. Затем объединенные клетки с метками загружаются в SCOPE-чип™ для лизиса клеток и штрихового кодирования. Метка образца (15nt) фланкируется универсальной ПЦР-ручкой и поли(A)-хвостом, которые захватываются олиго-dT бусинами. Метки образцов маркируются штрих-кодом клетки. Одновременно мРНК той же самой клетки также захватываются магнитным олиго-ДТ бисером на их поли(А)-хвосте и помечаются тем же клеточным штрих-кодом, а также UMI. Таким образом, все фрагменты кДНК из одной и той же клетки имеют общий знаменатель: клеточный штрих-код. И клеточный штрих-код, и метка CLindex гарантируют, что каждый транскрипт может быть связан с клеткой и образцом происхождения. Высокая эффективность маркировки Четыре независимые клеточные линии (NB4, THP1, U937 и CCRF) были помечены с помощью CLindex® и объединены в равные части перед разделением клеток на SCOPE-чипе®.