Оптическое картирование генома (ОГМ) требует меченой сверхвысокомолекулярной (СВМВ) ДНК для идентификации структурных вариантов. Bionano предлагает набор наборов для подготовки образцов ДНК для простого и надежного выделения сверхвысокомолекулярной ДНК из ряда важных типов образцов. После выделения ДНК наши наборы для прямой маркировки и окрашивания (DLS) могут быть использованы для маркировки ДНК для использования с системой Saphyr.
Надежное выделение и маркировка сверхвысокомолекулярной ДНК.
Для визуализации крупных структурных вариантов генома требуются исключительно крупные неповрежденные фрагменты ДНК. Технология фазы раствора (SP) Bionano позволяет выделять фрагменты ДНК, длина которых может достигать >1 Mbp, и регулярно дает средние фрагменты >230 kbp.
В перспективе секвенирование с коротким считыванием дает фрагменты длиной до 150 п.н., а высокоточное секвенирование с длинным считыванием обеспечивает длину фрагментов до 25 кб.
Выделение ДНК из целого ряда важных типов образцов.
Новейшие наборы для подготовки ДНК Bionano SP способны очищать сверхвысокомолекулярную ДНК из тканей и опухолей, аспирата костного мозга (BMA), крови и клеток, а также растительных и животных тканей. Такое разнообразие образцов делает ОГМ пригодным для использования в широком спектре исследований и приложений в онкологии, конституционально-генетических заболеваниях, биопереработке и общих исследованиях.
Наборы SP от Bionano требуют 1,5 * 10^6 клеток (кровь, клеточные линии и BMA) или 10 - 30 мг ткани в качестве исходного материала. ДНК UHMW выделяется примерно за четыре часа с использованием процесса лизиса, связывания и промывки, а также новых парамагнитных дисков.
---