Программное обеспечение NextGENe - идеальный аналитический партнер для анализа данных настольного секвенирования, производимых системами Illumina® iSeq, Miniseq, MiSeq, NextSeq, HiSeq и NovaSeq, системами Ion Torrent Ion GeneStudio S5, PGM и Proton, а также другими платформами.
Программное обеспечение NextGENe работает под управлением операционной системы Windows®, что обеспечивает удобный для биологов интерфейс "наведи и щелкни". Оно не требует сценариев или другой поддержки биоинформатики, которая часто требуется при использовании таких программ, как CLC Genomics Workbench, Lasergene's SeqMan Pro, а также академического программного обеспечения, такого как MAQ & SOAP, Top Hat, BWA & Bowtie.
Программное обеспечение NextGENe использует уникальные технологии, специфичные для конкретной платформы, в одном отдельно стоящем многофункциональном пакете. Программное обеспечение NextGENe содержит модули анализа для:
Обнаружения SNP/инделов
Зародышевая линия
Соматического
Захват экзома, секвенирование целого экзома (WES)
Секвенирование целого генома (WGS)
Анализ структурных вариантов (включая обнаружение слившихся генов)
Сравнение на основе семей и трио
Сравнение опухоли с нормой
Обнаружение вариаций числа копий (CNV) и альтернатива MLPA-подобному скринингу
сборка de novo
Транскриптом; анализ альтернативного сплайсинга и уровней экспрессии транскриптов
ChIP-Seq, цифровая экспрессия генов (DGE), анализ и количественное определение миРНК и метагеномика
Программное обеспечение NextGENe разработано в дружественной для биологов среде Windows®, что значительно снижает потребность в дополнительных ресурсах и затратах на биоинформатику. Программное обеспечение NextGENe использует недорогое 64-битное оборудование на базе ОС Windows. (Щелкните здесь для получения информации о предлагаемой конфигурации оборудования)
---