Гибкий набор для целевого секвенирования и молекулярного кодирования
Идентификация известных и неизвестных слитых транскриптов
Использование разработанных на заказ ген-специфических праймеров для синтеза первой
и/или синтеза второй нити
Экономически эффективная и гибкая альтернатива заранее разработанным панелям секвенирования
Секвенирование до 9 126 образцов/полоса
QuantSeq-Flex Kit - это протокол подготовки библиотеки, разработанный для создания совместимых с Illumina библиотек из любого образца РНК с использованием пользовательских праймеров. Он открыт для разработки продвинутыми пользователями РНК-Seq в соответствии с их индивидуальными потребностями.
Набор основан на стратегии QuantSeq FWD Kit for Illumina (кат. № 015), с совместимыми реагентами и линкерной последовательностью Read 1, введенной праймером для синтеза второй нити. Таким образом, считывания, генерируемые во время работы NGS, непосредственно соответствуют последовательности РНК.
Набор QuantSeq-Flex Kit содержит модули для обратной транскрипции (RT) и SSS, что позволяет пользователям выбирать собственные праймеры для одного из этих этапов или для обоих. Это обеспечивает максимальную гибкость в выборе мишеней и исходного материала.
С помощью этого очень гибкого набора QuantSeq можно генерировать следующие типы библиотек:
1.) OligodT праймированная при обратной транскрипции, случайная праймированная при синтезе второй нити (QuantSeq 3' mRNA-Seq)
2.) OligodT, праймированный в обратной транскрипции, специфически праймированный в синтезе второй нити (целевой 3' мРНК-Seq)
3.) Праймирование мишенью в обратной транскрипции, случайное праймирование в синтезе второй нити (целевая РНК-Seq, позволяет идентифицировать новые слияния)
4.) Праймирование мишени в обратной транскрипции, праймирование мишени в синтезе второй нити (целевая РНК-Seq, детектируются только известные мишени)
---