Набор реактивов в растворе QuantSeq-Pool

для подготовки банков РНК

Экономически эффективный метод анализа экспрессии генов для скрининговых проектов Раннее объединение и пакетная обработка позволяют экономить время без особых усилий Легко масштабируется от нескольких до 36 864 образцов QuantSeq-Pool - оптимальное решение для профилирования экспрессии генов в крупных проектах скрининга с использованием штрих-кодирования образцов, раннего объединения и пакетной обработки до 96 образцов в одной реакции, что обеспечивает легко масштабируемый рабочий процесс для мультиплексирования до 36 864 образцов. Высокая специфичность прядей QuantSeq-Pool поддерживает исключительную специфичность по строкам >99,9 % и позволяет сопоставлять чтения с соответствующей строкой генома, что позволяет обнаруживать и количественно оценивать антисмысловые транскрипты и перекрывающиеся гены. Прямой подсчет для количественного определения экспрессии генов На каждый транскрипт производится только один фрагмент, поэтому нормализация длины не требуется. Это позволяет более точно определять значения экспрессии генов и делает QuantSeq лучшей альтернативой микрочипам и традиционному RNA-Seq в исследованиях экспрессии генов. Простой биоинформационный анализ Картирование считываний упрощено благодаря отсутствию обнаружения перекрестков. Считывания генерируются на самом 3′ конце транскрипта, где почти нет стыков. Обработка данных может быть ускорена за счет использования, например, Bowtie2 вместо TopHat2. Уникальные молекулярные идентификаторы UMI встроены в QuantSeq-Pool и вводятся на самом первом шаге протокола. UMI имеют длину 10 нуклеотидов и считываются в начале считывания 2. Используйте информацию UMI для выявления дубликатов ПЦР и устранения погрешности амплификации.