Панель DepleteX RNA depletion удаляет самые высоко экспрессирующие инсулин транскрипты in-vitro перед секвенированием, перераспределяя кластеры секвенирования на уникальные биологически значимые транскрипты, что позволяет максимально увеличить UMI и чувствительность генов.
После удаления рибодеплеции образцы РНК обычно содержат небольшое количество высокоэкспрессированных, хорошо охарактеризованных транскриптов, и повторное секвенирование этих транскриптов добавляет мало биологически значимой информации. К сожалению, эти высокоэкспрессируемые транскрипты конкурируют с низкоэкспрессируемыми транскриптами за покрытие секвенирования. Недостаточное покрытие секвенирования в сочетании со значительным шумом от высокоэкспрессирующих транскриптов ограничивает обнаружение низкоэкспрессирующих генов, редких вариантов и уникальных событий слияния, которые могут быть факторами развития заболевания.
Основные моменты
Панель инсулинов, разработанная для удаления сверхэкспрессирующих транскриптов в образцах поджелудочной железы
Переназначение чтений секвенирования на транскрипты с более низкой экспрессией для увеличения охвата
Максимальное обнаружение вариантов и изоформ при меньшем количестве секвенирований
О сайте
Набор содержит тканеспецифичную направляющую РНК и реагенты для истощения библиотек
Спецификация
Образцы в наборе - 24
Ткани, исследуемые в данном проекте - Поджелудочная железа
Предназначен для уничтожения - 2 генов инсулина
---