Наш набор DepleteX High Expressing RNA Depletion удаляет самые высокоэкспрессирующие транскрипты in-vitro перед секвенированием, перераспределяя ~70%* чтений секвенирования на уникальные биологически значимые транскрипты, что позволяет максимально эффективно выявлять низкоэкспрессирующие транскрипты или редкие изоформы.
Повышение чувствительности обнаружения в фибробластах и цельной крови
Повторное секвенирование высокоэкспрессирующих транскриптов добавляет мало биологически значимой информации. К сожалению, эти транскрипты конкурируют с низкоэкспрессирующими транскриптами за покрытие секвенирования. Этот недостаток покрытия в сочетании со значительным шумом от высокоэкспрессирующих транскриптов ограничивает обнаружение низкоэкспрессирующих генов, редких вариантов и уникальных событий слияния, которые могут быть факторами заболевания.
DepleteX использует Cas9 и набор направляющих РНК, предназначенных для удаления 70 % самых высокоэкспрессирующих транскриптов из библиотек РНК-Seq, полученных из фибробластов и цельной крови. Этот набор был разработан для максимального переназначения общего количества чтений секвенирования, чтобы увеличить охват секвенированием редких, низкоэкспрессирующих транскриптов и уникальных событий слияния.
Основные моменты
Удаление >4 000 высокоэкспрессируемых транскриптов в цельной крови и фибробластах
Присвоение ~70%* большего количества чтений низкоэкспрессируемым биологически значимым транскриптам
Максимальное обнаружение вариантов и изоформ при меньшем количестве секвенирований
Повышенное обнаружение низкоэкспрессирующих транскриптов
Легко интегрируется в рабочий процесс благодаря простому и гибкому протоколу
О сайте
Набор включает направляющую РНК и реагенты для истощения библиотек.
Спецификация
Образцов в наборе - 24
Ткани, оцениваемые в дизайне - Фибробласт, цельная кровь
Содержание удаления - ~4,450 высокоэкспрессирующих транскриптов
---