Набор NGS FFPE DNA Library Prep Kit (illumina и MGI Platforms) был разработан для создания высококачественных библиотек FFPE DNA с использованием от 10 нг до 400 нг исходной ДНК, выделенной из образцов с формалиновой фиксацией и парафиновой эмбриональной оболочкой (FFPE). Повреждения ДНК, вызванные фиксацией, затрудняют создание библиотек высокого качества. Наш набор оптимизирован для восстановления поврежденной ДНК в ходе реакций. Возможно мультиплексирование библиотеки ДНК FFPE NGS.
Образцы FFPE - это большой ресурс для биомедицинских исследований. Однако методы фиксации и условия хранения значительно повреждают ДНК в образцах. Поэтому выделение высококачественной ДНК из образцов FFPE часто представляет собой сложную задачу. Низкий выход и низкое качество ДНК из FFPE - обычное явление из-за ограниченности тканевого материала и деградации ДНК.
В результате, как правило, трудно построить высококачественные NGS-библиотеки из малого количества и низкого качества ДНК FFPE. Чтобы решить эту проблему, мы разработали набор для подготовки библиотек NGS из ДНК FFPE, позволяющий создавать высококачественные библиотеки из образцов ДНК FFPE с небольшим количеством исходного материала.
Для набора NGS FFPE DNA Library Prep Kit платформы illumina доступны три типа индексов:
Без индекса: Библиотеки не имеют индекса.
Индекс: каждый из наших индексных праймеров содержит уникальный штрих-код ДНК (длиной 6 оснований), который может быть использован для идентификации отдельной библиотеки. Мультиплексирование библиотек до 48 образцов. Информацию об индексе можно скачать здесь.
Уникальный двойной индекс: Мультиплексирование библиотек ДНК FFPE возможно с 96 образцами на основе уникальной системы двойной индексации.
---