Обзор продуктаQuantCenter — модульное программное обеспечение для анализа Whole‑Slide изображений, разработанное для количественных рабочих процессов в гистопатологии и молекулярной патологии. Оно предоставляет конфигурируемые модули анализа, сегментацию на основе ИИ и глубокого обучения, пакетную обработку нескольких слайдов, интегрированную визуализацию и серверную обработку для масштабируемых исследований и высокопроизводительных задач.
Ключевые модули и функциональность- HistoQuant: идентифицирует окрашенные тканевые элементы по признакам цвета и интенсивности.
- PatternQuant: обучаемый модуль распознавания паттернов для классификации ткани и предварительной сегментации.
- PatternQuant Plus: версия PatternQuant на основе глубокого обучения для сложной сегментации тканей.
- NuclearQuant: обнаружение и количественная оценка клеточных ядер в образцах, окрашенных методом IHC.
- MembraneQuant: обнаруживает мембраны и количественно оценивает мембран‑ассоциированные IHC‑сигналы.
- CellQuant: универсальное приложение для обнаружения клеток при различных IHC‑окрасках (например, Ki67).
- DensitoQuant: инструмент для количественной оценки IHC на основе интенсивности окрашивания.
- FISHQuant: количественная оценка FISH‑сигналов в тканевых образцах солидных опухолей.
- CISHQuant: количественная оценка образцов, окрашенных методом CISH.
- DNA Break Quant: измеряет двойные разрывы ДНК путем детекции очагов γH2AX в иммуннофлуоресцентно окрашенных ядрах.
- ScriptQuant: выполнение пользовательских скриптов анализа изображений в среде QuantCenter.
- SimpleSlideInterface: программный доступ к метаданным слайдов и фрагментам изображений для разработки кастомных приложений.
- QuantServer: выполнение задач обработки и хранение результатов на выделенном сервере для централизованных высокопроизводительных рабочих процессов.
- BatchAnalysis-ProcessingQueue: фоновая очередь для пакетной обработки множества слайдов для повышения пропускной способности.
- Data Visualization (DVT): интегрированная визуализация (таблицы, диаграммы рассеяния, круговые диаграммы, гистограммы) для проверки результатов.
Интеграция и рабочий процессQuantCenter интегрируется с системами управления слайдами и поддерживает связываемые модули, что позволяет собирать адаптированные конвейеры анализа. Серверная обработка и централизованное хранение результатов обеспечивают масштабируемые внедрения и автоматизацию анализа проб исследования без использования внешних инструментов.
Примеры количественной оценки- Квантирование эндотелиальных клеток легочной артерии крупного рогатого скота (HistoQuant).
- Анализ эпителия Cyprinus carpio (PatternQuant).
- Анализ витреобразных структур с многослойными ядрами (PatternQuant).
- Анализ эстроген‑положительного инфильтрирующего протокового карциномы с использованием PatternQuant и NuclearQuant.
- Анализ тканей молочной железы, промаркированных Her2 (DensitoQuant).
- Обнаружение гольджи‑помеченных нейронных сетей в коре крысы (HistoQuant).
- Анализ тканей яичка с учётом сперматозоидов (HistoQuant).
Технические характеристики / спецификации- Модульный фреймворк, позволяющий выбирать и комбинировать специализированные модули количественной оценки.
- Настраиваемая сегментация на основе ИИ и глубокого обучения для сложных задач по анализу тканей.
- Пакетная обработка нескольких слайдов через фоновую очередь для повышения производительности.
- Серверная обработка (QuantServer) и централизованное хранение результатов для высокопроизводительных рабочих процессов.
- Интегрированные инструменты визуализации данных (таблицы, диаграммы рассеяния, круговые диаграммы, гистограммы) для проверки и отчетности.
- Поддержка интеграции пользовательских алгоритмов через ScriptQuant.
- Связываемые модули и бесшовная интеграция с управлением слайдами для автоматизации анализа исследований.
- Целевые модули для количественной оценки ядер, мембран, клеток, интенсивности окрашивания, сигналов FISH/CISH, очагов повреждения ДНК и классификации тканей по шаблонам.
- Масштабируемая архитектура, подходящая для исследований и клинических высокопроизводительных исследований.
- Разработано для воспроизводимой количественной оценки Whole‑Slide на распространённых форматах изображений.