Самый простой набор для NGS, требующий всего 30 минут практического времени для 96 образцов.
100%-ная готовность к автоматизации с единственным шагом ПЦР и без необходимости нормализации.
ПЦР в реальном времени позволяет проводить абсолютное количественное определение числа копий микроорганизмов.
ОПИСАНИЕ
Набор для подготовки библиотеки Quick-ITS Plus NGS - это самый быстрый и простой набор для подготовки библиотеки NGS, нацеленной на регион ITS, для высокопроизводительного секвенирования. Удобный для автоматизации протокол использует один qPCR/PCR для комбинированной направленной амплификации и добавления штрих-кода с помощью специально разработанных праймеров. После объединения в равные объемы проводится однократная очистка конечной библиотеки, а не массивная очистка с использованием бусин AMPure®. Дополнительные количественные анализы библиотек, такие как анализ на TapeStation® или гель-электрофорез, не требуются. Благодаря этим возможностям рабочий процесс значительно сокращает время подготовки библиотеки всего до 30 минут.
Размер ампликона - конечный размер ампликона после 1-ступенчатой ПЦР (направленная амплификация и добавление штрих-кода) составляет ~480 п.н.
Последовательности штрих-кодов - штрих-коды длиной 10 п.н., доступные для загрузки здесь (только для США) или в разделе "Документы" как "Последовательности штрих-кодов".
Индексные праймеры - двойной индекс (штрих-коды) для уникальной маркировки образцов.
Последовательности праймеров ITS - (адаптеры в комплект не входят)
ITS3f (GCATCGATGAAGAACGCAGC, 20 п.н.), ITS4r (TCCTCCGCTTATTGATATGC, 20 п.н.).
Необходимое оборудование - микроцентрифуга, устройство для вращения планшетов (центрифуга), 96-луночная система количественной ПЦР в реальном времени (совместимая с SYBR Green) или стандартная система ПЦР, 96-луночные планшеты для ПЦР в реальном времени.
---