Готовность к использованию: Готовые буферы обеспечивают молниеносную подготовку библиотек всего за 4 часа без ущерба для качества.
Улучшенная производительность: Приготовление библиотек с 7-кратным уменьшением митохондриального загрязнения, что позволяет экономить считывания и увеличивать глубину секвенирования.
Выдающаяся согласованность: Получение высококоррелированных реплик как из свежих, так и из замороженных образцов.
ОПИСАНИЕ
Набор Zymo-Seq ATAC Library Kit обеспечивает простой и оптимизированный рабочий процесс подготовки библиотек для анализа хроматина с доступом к транспозазе и высокопроизводительного секвенирования (ATAC-Seq) из клеток и тканей млекопитающих. Этот комплексный набор содержит простой и понятный протокол, позволяющий готовить библиотеки ATAC-Seq из 50 000 клеток всего за 4 часа с минимальными затратами времени.
Первоначальный лизис клеток происходит в щадящем режиме, что позволяет отделить важные ядра от лизированной клетки и собрать их, а загрязняющая митохондриальная ДНК остается в клетке и отбрасывается. Затем транспозаза, предварительно загруженная адаптерами Illumina, в ходе одной быстрой реакции одновременно фрагментирует и маркирует открытые участки хроматина. Наконец, меченая ДНК индексируется и амплифицируется с помощью ПЦР с набором праймеров UDI Tag Primer Set, в результате чего создаются высококачественные библиотеки, готовые к секвенированию на любом приборе Illumina.
Исходная ДНК - Для получения оптимальных результатов используйте 50 000 клеток на одну техническую реплику. Жизнеспособность клеток (показатель доли живых клеток в популяции) должна составлять >80%. Для точного измерения жизнеспособности рекомендуется использовать счетчик клеток.
Необходимое оборудование - микроцентрифуга, шкаф биологической безопасности, счетчик клеток, водяная баня, термоциклер,
---