Поскольку новые технологии окрашивания, такие как масс-цитометрия с визуализацией (IMC™, Standard BioTools) и высококомплексные флуоресцентные панели (Akoya PhenoCycler®), расширяют наши возможности по исследованию микроокружения опухоли с помощью пространственной биологии, поиск значимых различий в ваших данных становится сложной задачей.
Наш сквозной рабочий процесс для всех ваших потребностей в мультиплексном анализе изображений содержит все этапы в одном программном обеспечении:
Визуализировать
Импорт изображений из всех основных форматов мультиплексных изображений (Akoya Biosciences, Standard BioTools, Lunaphore, Rarecyte, Ionpath, Canopy Biosciences, Olympus, Zeiss и другие). Задайте определенные пользователем группы цветовых каналов комбинаций биомаркеров и легко переключайтесь между ними для быстрой визуализации типов клеток/групп маркеров и первоначального контроля качества изображения. Назначайте цвета отдельным каналам или группам каналов и просматривайте каждый канал, чтобы убедиться, что он содержит качественные данные. Исключите отдельные каналы из последующих анализов на этапе контроля качества.
Классификация тканей
Используйте сегментацию тканей на основе искусственного интеллекта Paint-to-Train для любой комбинации маркеров для обнаружения морфологических областей образца: опухоль, строма, некроз, артефакты и т.д. Используйте эти регионы для более точного определения локализации иммунных и других клеточных популяций по отношению к опухоли, строме и т.д. Далее разделить опухоль на субрегионы, автоматически исключить нерелевантные области (пустой слайд, артефакты и т.д.) и создать границы вокруг определенных регионов, представляющих интерес, например, для определения фронта инвазивной опухоли.
Обнаружение клеток
Используйте наши предварительно обученные алгоритмы обнаружения ядер и сегментации клеток на основе глубокого обучения для флуоресцентной (DAPI) и визуализирующей масс-цитометрии (ДНК-иридиевые каналы). Если у вас есть особые требования к обнаружению клеток,
---