Набор реактивов на магнитных шариках SMARTer®

для секвенирования РНК одиночных клетокдля протеинов

SMARTer Target RNA Capture for Illumina - это комплексная система, предназначенная для получения кДНК из обогащенной тотальной РНК. Целевой РНК-секвенирование позволяет преодолеть ряд проблем, присущих экспериментам по РНК-секвенированию с амплификацией всего транскриптома (WTA), улучшая охват последовательностей и чувствительность обнаружения интересующих транскриптов, которые могут присутствовать в малых количествах. Целевые подходы РНК-секвенирования также выгодны с точки зрения экономии затрат и упрощения анализа. Обогащение интересующих транскриптов до синтеза кДНК позволяет получить информацию о транскриптах, которые в противном случае могут быть пропущены или для обнаружения которых требуется гораздо большее количество секвенирующих чтений, включая слияния химерных генов, изоформы транскриптов и варианты сплайсов. Благодаря повышению чувствительности улучшается и мощность анализа, что проявляется в снижении отношения сигнал/шум. SMARTer Target RNA Capture for Illumina используется для получения кДНК из обогащенных транскриптов РНК. Целевые биотинилированные ДНК-зонды, разработанные пользователем, гибридизуются с интересующими транскриптами, а полученные гибриды РНК-ДНК захватываются с помощью Capture Beads. Этот набор использует преимущества чувствительности набора SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencing для получения высококачественной полноразмерной кДНК из этих обогащенных транскриптов. Набор был протестирован с 10 нг тотальной РНК и показал, что может выполнять синтез кДНК из обогащенных транскриптов, полученных всего из 100 пг очищенной тотальной РНК. Библиотеки кДНК, созданные с помощью этого набора, были протестированы на совместимость с платформами секвенирования Illumina. Этот метод не требует дополнительных методов или наборов для удаления рРНК.