Набор реактивов на магнитных шариках SMARTer®

для секвенирования РНК одиночных клетокдля протеинов

SMARTer Target RNA Capture for Illumina - это комплексная система, предназначенная для получения кДНК из обогащенной тотальной РНК. Целевая РНК-секвенирование позволяет преодолеть ряд проблем, присущих экспериментам по РНК-секвенированию с амплификацией всего транскриптома (WTA), улучшая покрытие последовательностей и чувствительность обнаружения интересующих транскриптов, которые могут присутствовать в малых количествах. Целевые подходы к РНК-секвенированию также выгодны с точки зрения экономии средств и упрощения анализа. Обогащение интересующих транскриптов до синтеза кДНК позволяет получить информацию о транскриптах, которые в противном случае могут быть пропущены или для обнаружения которых требуется гораздо большее количество секвенирующих чтений, включая слияния химерных генов, изоформы транскриптов и варианты сплайсов. Благодаря повышению чувствительности улучшается и мощность анализа, что проявляется в уменьшении соотношения сигнал/шум. В рабочем процессе SMARTer Target RNA Capture for Illumina общая РНК гибридизуется с разработанными пользователем биотинилированными ДНК-зондами менее чем за четыре часа, а затем очищается перед захватом на Capture Beads - магнитные частицы, покрытые стрептавидином. Capture Beads были выбраны потому, что они демонстрируют особенно низкую адсорбцию белка и нуклеиновых кислот и не мешают последующим реакциям, таким как ПЦР или обратная транскрипция, что позволяет проводить синтез кДНК на целевых образцах, пока они остаются прикрепленными к бусинам. Бусины Capture Beads входят в состав набора SMARTer Target RNA Capture for Illumina, а также продаются отдельно.