Готовые к использованию конвейеры для анализа РНК-секвенирования на основе алгоритмов QIAGEN CLC
Совместимость с наиболее распространенными наборами для подготовки библиотек
Простой, интуитивно понятный поиск и фильтрация дифференциально экспрессированных генов на удобной интерактивной приборной панели
Поддержка интерпретации посредством аннотирования наиболее влиятельных путей, восходящих потоков
регуляторов, заболеваний и функций, запрашиваемых из базы знаний QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA)
Поддержка принятия решений в экспериментах по проверке биомаркеров с помощью продукта
рекомендации по продуктам и удобные инструменты индивидуального проектирования в центре проектирования и анализа QIAGEN GeneGlobe
Детали продукта
Решения GeneGlobe Analyze сочетают в себе лучшие в отрасли алгоритмы и знания с простотой использования. Облачный портал QIAGEN RNA-seq Analysis Portal доступен из GeneGlobe Analyze и позволяет анализировать данные RNA-seq, от выравнивания необработанных чтений до интерпретации дифференциально экспрессированных генов и поиска нужных инструментов для проверки потенциальных биомаркеров.
Производительность
Портал QIAGEN RNA-seq Analysis Portal сокращает время анализа с нескольких дней до нескольких часов:
анализ микроРНК: требуется всего 90 минут от файла fastq до дифференциальной экспрессии (на основе данных из набора QIAseq miRNA Library Kit, 96 образцов с ~5 млн чтений на образец, одноконцевые чтения 75 bp)
Анализ всего транскриптома: требуется всего 4 часа от файла fastq до дифференциальной экспрессии (на основе данных из набора QIAseq Stranded RNA Library Kit, 96 образцов, 60 М чтений на образец, парные чтения 2 x 75 bp)
---