Набор Ampli1 WGA PLUS был разработан и оптимизирован для сбалансированной и полной амплификации общего содержания ДНК одной человеческой клетки.
Исходная ДНК (из одной клетки и до 1000 клеток в ~1 мкл PBS) может быть получена из свежих/живых и/или фиксированных клеток (PFA2%, CellSave, CellRescue пробирки). Набор также может быть использован для амплификации до 10 нг геномной ДНК (например, из образцов тканей или FFPE).
После лизиса клеток ДНК переваривается ферментом рестрикции, и адаптеры лигируются к фрагментам ДНК. Это гарантирует, что для любого данного локуса генома соответствующие аллели амплифицируются в виде геномных фрагментов одинаковой длины и почти идентичного содержания GC, что резко снижает выпадение аллелей из-за разной эффективности амплификации исходных молекул ДНК. Амплификация, проводимая в одной пробирке, опосредуется одним высокоспецифичным универсальным ПЦР праймером для всех фрагментов и использует ДНК-полимеразу с 3'→5' экзонуклеазной корректорной активностью, с точностью в 6,5 раз выше, чем у стандартной Taq ДНК-полимеразы.
Результатом протокола Ampli1 WGA является хорошо сбалансированная библиотека фрагментов размером около 0,2-2 кб, представляющих весь геном.
С продуктом Ampli1 WGA PLUS совместимы многие различные виды последующих аналитических процедур, такие как определение вариантов методом Сэнгера или секвенирования следующего поколения (NGS), микросателлитный или другой анализ генотипирования на основе ПЦР, метафазный CGH, массивный CGH и анализ числа копий в масштабе всего генома методом NGS.
Два специализированных набора для последующего анализа: Ampli1 OncoSeek Panel и Ampli1 LowPass Kit for Illumina,
---