Точные оценки концентрации транскриптов
Точное определение дифференциальной экспрессии
Исключительная воспроизводимость в различных условиях
Быстрое время работы и малый объем памяти
Программное обеспечение для анализа данных РНК-Seq Mix²
Программный инструмент для точной оценки концентрации РНК по данным RNA-Seq.
Модель
Смещение фрагментов в RNA-Seq представляет собой серьезную проблему для точной количественной оценки изоформ генов. Mix² не делает никаких предположений о смещении покрытия, а подгоняет для каждой изоформы гена модель смеси к данным (рис. 1). Поэтому Mix² может, например, точно представить смещение 5', как показано на рис. 1 (a и b), тогда как Cufflinks ограничивается равномерным распределением (рис. 1c).
Программный инструмент для точной оценки концентрации РНК по данным RNA-Seq.
---