Этот продукт является новой и улучшенной заменой набора CRISPRclean Single Cell RNA Boost Kit (KIT1018).
Набор DepleteX™️ удаляет обильные и неинформативные фрагменты перед секвенированием, перераспределяя 50% кластеров секвенирования на информативные чтения, которые обычно отфильтровываются перед вторичным анализом. В этом наборе используется обеднение Cas9 с оптимизированным набором направляющих для удаления рибосомальной и митохондриальной мРНК, нетранскриптомных чтений и высокоэкспрессируемых невариабельных генов. Этот новый набор включает отдельную пробирку для содержимого, предназначенного для удаления непеременных генов, которое можно включать или исключать по мере необходимости.
Набор DepleteX Single Cell RNA Boost Kit дает вам возможность преодолеть шум и получить максимум полезных данных при секвенировании РНК одной клетки.
Основные характеристики
увеличение количества чтений, полезных для вторичного анализа, на ~50 %
Проверено для секвенирования с короткими и длинными чтениями
Удаляет рибосомальные, митохондриальные, нетранскриптомные чтения и непеременные гены (опционально) из библиотек одиночных клеток
Простой 3-шаговый протокол
Спецификация
Образцы в одном наборе - 24
Время анализа - 2 часа
Время работы руками - 45 минут
Исходные данные - Используется одна из четырех аликвот кДНК хрома для подготовки
Метод - Одноклеточная РНК-секвенирование
Предназначен для удаления рибосомальных, митохондриальных, нетранскриптомных чтений и непеременных генов (опционально)
Jumpcode validated - 10x Genomics Chromium Next GEM Single Cell 3' Reagent Kits v3.1, Visium Spatial Gene Expression libraries, PacBio Iso-Seq SMRTbell Express Template Prep Kit 2.0, BD Rhapsody
Клиенты подтвердили - 10x Genomics Chromium 5' и multiome, Parse Biosciences Evercode Whole Transcriptome
---