TargetPlex FFPE-Direct NGS 78-Gene Cancer Hotspot Panel - Primer Pool был разработан для определения 78 онкогенов или генов-супрессоров опухоли с общим количеством ампликонов 378 в трех пулах праймеров (5x). Праймеры разработаны с использованием инновационной технологии шумоподавления TargetPlex для повышения эффективности секвенирования и улучшения чувствительности обнаружения до 1% частоты аллелей. Данный продукт содержит только пул праймеров TargetPlex и требует набора TargetPlex Library Prep Kit по каталогу (совместимый с Illumina) или набора по каталогу (совместимый с Ion Torrent) для завершения библиотеки.
Список генов: ( )=количество ампликонов
AKT1 (1), AKT2 (1), AKT3 (3), ALK (7), APC (10), AR (2), ARAF (1), ARID1A (9), BAP1 (8), BRAF (3), BRCA1 (2), BRCA2 (2), CDH1 (4), CDK4 (1), CDKN2A (3), CSF1R (2), CTCF (8), CTNNB1 (1), DDR2 (1), ERBB3 (6), ERBB4 (5), ESR1 (4), FAT1 (2), FBXW7 (10), FGFR3 (5), FOXL2 (1), GATA3 (2), GNA11 (2), GNAQ (2), H3F3A (1), HIST1H3B (1), HNF1A (9), IDH1 (1), IDH2 (2), JAK2 (3), KDR (10), KEAP1 (1),KIT (15),KMT2C (2),KMT2D (4),KRAS (3), MAP2K1 (7), MAP2K2 (1), MAP3K1 (3), MLH1 (1), MTOR (4), NF1 (4), NFE2L2 (2), NOTCH1 (8), NRAS (4), PDGFRA (4), PIK3CA (11), PIK3R1 (8), POLE (2), PTEN (23), RAC1 (3), RB1 (5), RET (7), RHOA (3), ROS1 (2), SF3B1 (5), SMAD4 (7), SMARCB1 (4), SMO (4), SRC (1), STK11 (22), TP53 (23), TSC1 (1), TSC2 (2), U2AF1 (2), VHL (3)
---