Уникальные двухиндексные праймеры для мультиплексирования содержат смесь праймеров для мультиплексирования образцов для секвенирования следующего поколения (NGS) на платформе illumina. Мультиплексирование образцов NGS позволяет снизить стоимость секвенирования за счет объединения нескольких библиотек NGS на одной дорожке проточной кюветы.
Мы разработали систему индексов с разницей в четыре базиса. Эта система позволяет создавать индексы, отличающиеся друг от друга как минимум на 4 основания в индексе длиной 8 оснований. Наши уникальные праймеры с двойной индексацией устраняют такие ошибки секвенирования, как скачки индексов, перекрестное загрязнение индексов, неправильное распределение чтений, ошибки амплификации и ошибки де-мультиплексирования.
Характеристики
Повышает специфичность идентификации образцов благодаря системе индексов с разницей в 4 основания
Каждый индекс имеет не менее 4 оснований, отличающихся от других индексов
разница в 4 основаниях значительно повышает специфичность по сравнению с 3 основаниями у других производителей.
Повышает способность к мультиплексированию
96 предварительно смешанных уникальных пар праймеров с индексами i5 и i7
Минимизирует ошибки секвенирования, такие как:
Скачки индекса
Перекрестное загрязнение индексов
Неправильное распределение чтений
Ошибки амплификации
Ошибки демультиплексирования
Идентификация скачков индекса по уникальному двойному индексу. 96 библиотек были созданы с помощью набора BioDynami NGS DNA Library Prep Kit и праймеров BioDynami Multiplexing Unique Dual Index Primers. Библиотеки были объединены в пулы одинаковой концентрации и секвенированы на приборе illumina HiSeq 4000. Количество чтений из всех библиотек было демультиплексировано и проанализировано.
Демультиплексирование: правильная комбинация индексов i5 и i7
Выявленные скачки индексов: правильные штрих-коды, но НЕ правильная комбинация индексов i5 и i7
Прочее: не подходит под вышеуказанные категории
---