Поисковые справочные данные, построенные для интеграции с Nexus
БД Nexus является бесценным ресурсом и входит в состав всех подписок Nexus Copy Number.
Особенности и преимущества
Хранить свои данные
Как пользователь Nexus, вы можете использовать NexusDB для хранения ваших собственных данных, в частном порядке. Данные защищены за пределами сайта с помощью AWS-платформы Amazon.
Справочные данные
Запрос по генам или регионам, представляющим интерес, для быстрого поиска образцов и клинических аннотаций, с возможностью сравнения данных, полученных с помощью различных платформ aCGH, SNP-массивов и NGS.
Справочные данные в БД Nexus
Возможность легко обмениваться собственными данными с людьми, которых вы выбираете и с которыми вы сотрудничаете по всему миру.
Доступные данные в БД Nexus
конституционная генетика
AGRE - Обмен генетическими исследованиями аутизма. Все данные доступны в геномах HG18 и HG19.
ISCA/ICCG (dbVAR) - база данных структурных вариаций (SV) геномных вариантов с клиническими аннотациями для широкого круга конституциональных генетических нарушений.
Affymetrix CytoScan HD Reference Project - 375 нормальных образцов, используемых для создания эталонного файла ЦитоСкана HD
Рак
TCGA Premier - переработанные и курируемые вручную данные TCGA, в результате чего значительно повышается точность и соответственно уменьшается количество ложноположительных вызовов.
Даты включают острую миелоидную лейкемию, глиобластому (ГБМ), аденокарциному яичниковой серостой кисты, ячеисто-клеточную карциному почек, аденокарциному толстой кишки, плоскостную карциному легких и многое другое.
---