Быстрота: в 8 раз меньше времени, затрачиваемого на работу, по сравнению с обычными протоколами подготовки 16S-библиотек.
Простота: пластины с премиксом позволяют свести к минимуму время работы и ошибки при обработке.
Простой рабочий процесс: 100% автоматизация с одним шагом ПЦР и отсутствием необходимости в нормализации. Просто объедините их по одинаковому объему!
ОПИСАНИЕ
Набор для подготовки библиотеки Quick-16S Plus NGS (V4) - это самый быстрый и простой набор для подготовки библиотеки NGS, нацеленной на область V4 гена 16S рРНК для высокопроизводительного секвенирования. Удобный для автоматизации протокол использует планшет с готовой смесью для амплификации и одну qPCR/PCR для комбинированной направленной амплификации и добавления штрих-кода. Объединение в пулы равного объема и однократная очистка конечной библиотеки, а не массивная очистка с использованием бусин AMPure®, упрощают процесс подготовки библиотеки. Нет необходимости в проведении дополнительных количественных анализов библиотек, таких как анализ на TapeStation® или гель-электрофорез. Благодаря этим возможностям рабочий процесс значительно сокращает время подготовки библиотеки всего до 30 минут.
Размер ампликона - конечный размер ампликона после 1-ступенчатой ПЦР (направленная амплификация и добавление штрих-кода) составляет ~388 п.н.
Необходимое оборудование (предоставляется пользователем) - микроцентрифуга, вращатель тарелок (центрифуга), 96-луночная система количественной ПЦР в реальном времени (рекомендуется совместимая с SYBR Green) или стандартная система ПЦР, 96-луночные планшеты для ПЦР в реальном времени.
Последовательности индексов - индексы длиной 10 п.н. перечислены в прилагаемом шаблоне MiSeq Sample Sheet Template.
Исходный образец - очищенная микробная ДНК (≤100 нг), не содержащая ингибиторов ПЦР.
Платформа секвенирования - совместим со всеми платформами секвенирования Illumina® с использованием собственных праймеров. Мы рекомендуем набор реагентов MiSeq® Reagent Kit v2 (300 циклов).
---