Набор реактивов в растворе Zymo-Seq

подготовки банков ДНКдля ДНК

Оптимизирован для ввода малых фрагментов: Идеально подходит для небольших и поврежденных фрагментов ДНК, таких как бесклеточная ДНК (cfDNA). Точное определение метилирования: Протокол, основанный на прямом лигировании, обеспечивает точное считывание и определение метилирования нативных терминалей для каждого фрагмента ДНК. Оптимизированный и простой рабочий процесс: Подготовка надежных библиотек метил-секвенирования занимает всего 3 шага. ОПИСАНИЕ Набор Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit обеспечивает оптимизированный и надежный процесс подготовки бисульфитных библиотек для полногеномного секвенирования (WGBS) из бесклеточной ДНК (cfDNA). Этот комплексный набор представляет собой простую процедуру, позволяющую получать высококачественные библиотеки метил-секвенирования из всего лишь 5 нг кфДНК. Процесс осуществляется в три основных этапа: бисульфитная конверсия, прямое лигирование адаптера и индексная ПЦР-амплификация. Первоначальная бисульфитная обработка является щадящей для кфДНК, но при этом эффективно преобразует все немодифицированные цитозины в урацил. Затем инновационные адаптеры с шипами захватывают и непосредственно лигируют совместимые с Illumina адаптеры на фрагменты ДНК любого размера, что позволяет секвенировать зазубренные, поврежденные и короткие фрагменты ДНК, которые в противном случае могли бы быть отброшены при использовании традиционных методов подготовки библиотек. Прямое лигирование адаптеров также устраняет необходимость в синтезе второй нити, восстановлении концов и выделении dA, что снижает погрешность за счет сохранения целостности нативного метилирования, присутствующего на концах фрагментов. Наконец, сшитая с адаптерами кфДНК индексируется и амплифицируется с помощью ПЦР с UDI Zymo-Seq, в результате чего создаются библиотеки, готовые к секвенированию на любом приборе Illumina. Последовательности штрих-кодов - см. раздел "Документы".