Все бактерии и археи содержат рибосомную субъединицу 16S длиной около 1500 нуклеотидов, состоящую из девяти гипервариабельных областей (V1-V9), распределенных между высококонсервативными областями, характерными для конкретного рода или вида. Секвенирование гена 16S рибосомальной РНК (рРНК), являющегося признанным генетическим маркером, представляет собой золотой стандарт анализа бактериальных образцов для идентификации и классификации как чистых культур, так и смешанных образцов. Благодаря внедрению секвенирования следующего поколения (NGS) метод 16S рРНК также широко используется для деконволюции сложных микробных сообществ, таких как микробиом кишечника человека.
Регион V1-V9 лучше других субрегионов способен различать виды бактерий. EasySeq™ 16S rRNA V1-V6 и V9 Bacterial ID обеспечивает полный анализ вариабельных областей V1-6 и V9 гена 16S rRNA бактерий. Этот набор позволяет использовать стратегию идентификации бактерий с помощью NGS для исследования инфекционных заболеваний, контаминации и анализа первопричин в клинических образцах.
Совместимость набора с платформами
Обратите внимание: набор EasySeq™ 16S rRNA V1-6 и V9 Bacterial ID NGS Library Prep Kit предназначен для секвенирования гипервариабельных областей V1-V6 и V9 в мультиплексной реакции с использованием двух различных панелей зондов. Для этого требуется два уникальных двухиндексных планшета для совместного использования.
Набор EasySeq™ 16S rRNA V1-6 и V9 Bacterial ID Sequencing Kit используется с ДНК, выделенной из чистых культур, а также позволяет проводить прямую амплификацию ДНК из клинических материалов.
---