мРНК-Seq, включая поли(А) селекцию
Широкий диапазон входных данных тотальной РНК (от 1 нг до 1 мкг)
Простой рабочий процесс "все в одном
От отбора поли(А) до готовых к секвенированию библиотек за 5,5 часов
Включены уникальные молекулярные идентификаторы (UMI)
12 нт Уникальные двойные индексы (UDI) включены
Набор для подготовки библиотек КОРАЛЛ mRNA-Seq позволяет быстро и экономически эффективно создавать библиотеки с нитями, меченными UMI и уникальными двойными индексами для анализа поли(A) РНК всего транскриптома на платформах Illumina® NGS.
Превосходное покрытие от конца до конца
Всестороннее покрытие CORALL обеспечивает улучшенное представление начального и конечного участков транскрипта. Покрытие чтений анализировалось с использованием контролей ERCC spike-in, которые имеют точные, известные сайты начала и конца транскрипции (TSS и TES, соответственно). Прочтения CORALL более точно отображаются на точные TSS ERCC (рис. 3A) по сравнению с конкурирующими библиотеками, которые не покрывают истинные начальные сайты. Кроме того, CORALL обеспечивает более высокий уровень покрытия в TES (рис. 3B).
Анализ данных
На платформе BlueBee® Genomics Platform теперь доступен конвейер анализа данных. С помощью этого конвейера пользователи набора могут выполнять контроль качества чтения, картирование, дедупликацию уникального молекулярного идентификатора (UMI) и количественную оценку транскриптов. Для использования кода активации необходимо зарегистрировать учетную запись в BlueBee (https://lexogen.bluebee.com/portal) и загрузить данные (файлы fastq.gz).
ПРИМЕЧАНИЕ! Анализ данных BlueBee доступен для ряда видов, пожалуйста, обратитесь к FAQ 7. Эталонные геномы для новых видов могут быть добавлены по запросу. Обратите внимание, что за это взимается плата. Более подробную информацию см. в разделе Анализ данных CORALL.
---