Анализировать кинетику синтеза и оборота РНК в масштабах транскриптома
Измерять экспрессию зарождающейся РНК и стабильность транскриптов
Усилить временное разрешение дифференциальной экспрессии
Идентифицировать первичные и вторичные транскрипционные мишени
Не требуется вытягивание или биохимическая изоляция
Используйте в сочетании с QuantSeq 3' mRNA-Seq для экономически эффективного использования,
высокопроизводительного секвенирования метаболизма
SLAMdunk - автоматизированный и удобный для пользователя анализ данных SLAMseq-QuantSeq
конвейер на платформе анализа геномики BlueBee ®
SLAMseq - это высокочувствительный метод измерения вновь синтезированной и существующей РНК в культивируемых клетках. SLAMseq позволяет определить кинетику синтеза и деградации РНК.
Lexogen предлагает семейство наборов, основанных на новом методе SLAMseq: Тиол (SH)-связанное алкилирование для метаболического секвенирования РНК. SLAMseq позволяет идентифицировать и количественно определять вновь синтезированную (зарождающуюся) и существующую РНК из одного и того же образца параллельно, без необходимости биохимической изоляции. SLAMseq может быть легко применен в экспериментах с живыми клетками. В сочетании с подготовкой 3' библиотеки мРНК-Seq QuantSeq, SLAMseq обеспечивает полное удобное и высокопроизводительное решение для анализа кинетики синтеза и оборота РНК в масштабах транскриптома.
Портфель наборов SLAMseq включает модули Explorer и Kinetics, которые охватывают весь эксперимент по маркировке метаболической РНК, от оптимизации условий маркировки до маркировки зарождающейся или существующей РНК и алкилирования для последующей подготовки библиотеки NGS.
---