ОбзорTruPath Genome — это набор для секвенирования всего генома человека (WGS), разработанный для получения всестороннего покрытия генома при минимальном времени ручной подготовки. Рабочий процесс исключает традиционную подготовку библиотеки, выполняя тагментацию непосредственно на flow-cell, что обеспечивает высокоточные короткие риды в сочетании с mapped-read/ proximity-данными для улучшенного дальнего геномного разрешения.
Ключевые особенности- Минимальный ручной ввод: примерно 10 минут подготовки образца.
- Сочетание высокоточного короткого рид-секвенирования с mapped-read и proximity-данными для расширенной информации на дальние расстояния.
- Улучшенное обнаружение структурных вариантов и разрешение труднокартируемых областей, а также расширенные возможности фазирования.
- Тагментация на flow-cell устраняет необходимость в традиционной подготовке библиотеки перед секвенированием.
- Совместимо с системами NovaSeq X Series.
Документация и ресурсы по продукту (избранное)- Технический паспорт, рекламные материалы, примечания к применению и технические заметки, описывающие метод TruPath Genome, характеристики образцов и рабочие процессы.
- Документация по поддержке и программному обеспечению для TruPath Genome и анализа germline в DRAGEN.
- Видео-материалы и вводные материалы, поясняющие технологию mapped-read и возможности TruPath Genome.
Характеристики / технические спецификации- Время проведения анализа: ~29 ч (включая время секвенирования).
- Описание: позволяет разрешать труднокартируемые участки и обеспечивает всестороннее покрытие генома с улучшенным обнаружением структурных вариантов и фазированными ридами/вызовами вариантов.
- Время ручной подготовки: ~10 мин.
- Входной материал: 350 ng.
- Инструменты: NovaSeq X System; NovaSeq X Plus System.
- Механизм действия: тагментация на flow-cell.
- Метод: секвенирование всего генома.
- Тип нуклеиновой кислоты: ДНК.
- Количество реакций: 2 или 8 образцов в комплекте.
- Детали по типу образцов: рекомендуется экстракция ДНК высокого молекулярного веса.
- Специализированные типы образцов: кровь; мазки из полости рта; слюна.
- Категория вида: человек.
- Технология: секвенирование (mapped-read / proximity-enabled sequencing).
- Классы вариантов: короткие тандемные повторы (STR); однонуклеотидные полиморфизмы (SNP); однонуклеотидные варианты (SNV); вставки-делеции (indels); варианты числа копий (CNV); структурные варианты; перестройки генов; потеря гетерозиготности (LOH); хромосомные аномалии; герминальные варианты.