в результате этого был создан полный геном основных пород крупного рогатого скота, что позволило использовать его в таких областях, как геномная селекция, идентификация локусов количественных признаков, оценка генетических достоинств особей и сравнительно-генетические исследования.
Этот BeadChip был разработан компанией Illumina в сотрудничестве с USDA-ARS, Университетом Миссури и Университетом Альберты. Более 22 000 SNP-зондов нацелены на новые SNP-локусы, которые были обнаружены в результате секвенирования компанией Illumina трех объединенных популяций экономически важного мясного и молочного скота.
Дополнительный контент взят из общедоступных источников, таких как эталонный геном крупного рогатого скота, Btau и набор данных консорциума Bovine HapMap. Все SNP-зонды были проверены на 18 распространенных мясных и молочных породах. Данный продукт нацелен на равномерно распределенные SNP, которые полиморфны по всем проверенным породам, и обеспечивает среднее расстояние между ними 37,4 кб.
Этот 24-выборочный BeadChip представляет собой решение для генотипирования высокой плотности для определения характеристик генома молочного и мясного скота
Однопробочная пробоподготовка без ПЦР1,2 значительно сокращает трудозатраты и возможные ошибки при работе с образцами
Система управления лабораторной информацией на основе массива и роботизированная автоматизация позволяют точно и эффективно отслеживать образцы на протяжении всего анализа
Для высокопроизводительного и экономически эффективного генетического скрининга массив BovineSNP50 BeadChip содержит более 53 000 равномерно расположенных SNP-зондов, охватывающих геном крупного рогатого скота. Для большей гибкости в версию BovineSNP50+ BeadChip можно включить до 600 000 дополнительных маркеров.
Технические характеристики
Тип анализа - Infinium HTS
Возможности автоматизации - автоматический загрузчик массивов, робот(ы) для обработки жидкостей
---