Разработанные в сотрудничестве с экспертами в области геномики рака, эти готовые к использованию олигосы позволяют исследователям проводить секвенирование различных генов и однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs), ранее связанных с предрасположенностью к раку.
Нацеленность на 94 гена и 284 SNP, связанных с предрасположенностью к раку
TruSight Cancer включает гены, связанные как с распространенными (например, рак груди, колоректальный рак), так и с редкими видами рака. Кроме того, в набор включены 284 SNP, которые, как выяснилось, коррелируют с раком в результате исследований геномных ассоциаций (GWAS). Отбор контента осуществлялся на основе экспертной оценки научной литературы и других высококачественных ресурсов.
Панель секвенирования TruSight Cancer предоставляет пользовательские олиго, нацеленные на идентифицированные регионы, представляющие интерес. Поставляется достаточное количество продукта для четырех реакций обогащения. TruSight Cancer совместима с TruSight Rapid Capture.
Наборы данных образцов TruSight Cancer
с помощью панели секвенирования TruSight Cancer было подготовлено 6 эталонных образцов человека. Эти библиотеки были секвенированы на MiniSeq System с использованием высокопроизводительного набора при конфигурации длины чтения 2 x 100 bp с двойной индексацией. Общий выход составил 5,2 Гб с 95,8 % оснований на уровне или выше Q30.
Технические характеристики
Время анализа - 1,5 дня
Тип рака - пан-рак
Характеристики содержимого - Фиксированный набор зондов, обогащенных 94 генами и 284 SNP, ассоциированными с распространенными и редкими видами рака.
Описание - Исследование на выявление мутаций в зародышевой линии для распространенных и редких видов рака.
Время практической работы - 5 часов
Исходное количество - 50 нг ДНК
Приборы - MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx в исследовательском режиме, MiniSeq System, NextSeq 500 System
Метод - целевое секвенирование ДНК, обогащение мишеней
Мультиплексирование - до 96 комплексов
---