2'-Дезокси-2'-фтор-нуклеозиды принимают сахарную конформацию типа РНК, предположительно из-за высокой электроотрицательности фтора. Из-за этой сахарной конформации РНК-дуплексы (А-форма) обычно более термодинамически стабильны, чем ДНК-дуплексы (В-форма). Как и ожидалось, добавление остатков 2'-F-РНК к олигодезоксинуклеотидам постепенно увеличивает термостабильность их дуплексов с РНК. Стабилизация аддитивна и составляет примерно 2° на остаток. Это выгодно отличается от 2'-ОМе-РНК - около 1,5° и РНК - 1,1° на остаток. При этом специфичность пар оснований остается нетронутой.
фосфодиэфирные связи 2'-F-РНК не устойчивы к нуклеазе, хотя соответствующие фосфоротиоатные связи очень устойчивы. Исследователи обычно разрабатывают антисмысловые олигонуклеотиды для образования дуплексов с РНК, которые затем становятся субстратами для РНКазы Н. Однородно модифицированные дуплексы 2'-F-РНК/РНК не являются субстратами для РНКазы Н. Однако легко приготовить химерные фосфоротиоатные олигонуклеотиды 2'-F-РНК/ДНК, которые демонстрируют усиленное связывание с РНК-мишенью, являются субстратами для РНКазы Н и очень устойчивы к нуклеазе.
Технические характеристики
Химия
Молекулярная масса/вес - 307,17
Хранение и стабильность
Состояние суспензии -
- Коротко прокрутите пробирку, чтобы собрать гранулы в нижней части пробирки - Добавьте соответствующий объем рекомендованного буфера (см. технические характеристики) - Дайте пробирке постоять несколько минут - Вортексируйте пробирку в течение 15 секунд
---