LIS для анализа RiboPrinter®

для управления даннымидля лабораторий

Риботипирование - это технология, основанная на фрагментах, в которой используются ферменты рестрикции, нацеленные на участки генов рибосомальной РНК (5S, 16S, 23S и область спейсера, включающая Glu-тРНК) и вырезающие их, в результате чего образуется отпечаток ДНК, уникальный для организма на уровне штамма. Система Ribotyping объединяет образцы, чьи паттерны RiboPrint® находятся в пределах фиксированной степени сходства. Эти образцы могут быть получены до или после друг друга и могут использоваться для определения степени сходства между изолятами в рамках программы мониторинга окружающей среды (EM). Наша команда создала и поддерживала пользовательскую библиотеку для каждого клиента, предоставившего образцы для рибопринтинга. Каждый раз, когда клиент присылал новый образец, он сравнивался со всеми предыдущими образцами в его пользовательской библиотеке и присваивался рибогруппе. В некоторых случаях автоматическое риботипирование может быть менее эффективным, чем типирование штаммов на основе последовательности, поскольку у некоторых видов очень мало разнообразия в составе оперона рибосомальной РНК, анализируемого с помощью RiboPrinter®. В таких случаях методы последовательной характеристики бактериальных штаммов (SLST и MLST) могут обеспечить гораздо более высокий уровень дискриминации и воспроизводимости, чем автоматическое риботипирование, и должны быть рассмотрены в обязательном порядке. Что такое риботипирование бактериальных штаммов? Риботипирование - это автоматизированный фрагментарный анализ отпечатка ДНК организма с помощью системы RiboPrinter® для характеристики бактерий. Что такое рибопринтинг? Рибопринтинг - это технология, основанная на фрагментах, в которой используются ферменты рестрикции для нацеливания и вырезания участков генов рибосомальной РНК (5S, 16S, 23S,